经过短暂的休息调整，杜克迅速转入到了《黑暗骑士崛起》的后期制作当中，与过往一样，他仍然选择了华纳制作厂作为后期制作的大本营。
参与制作的特效团队同样来自工业光魔及其众多的合作伙伴和下级承包商，团队的特效总监曾与杜克一起制作过所有《蝙蝠侠》系列电影和《盗梦空间》，在他的领导下，团队已经制作出了不少视觉特效和动画镜头，震撼的场面也得到了杜克的认可。
按照杜克的规划，这部影片时长最少也有两个半小时，电脑特效视效镜头将超过3000个，甚至有些镜头会让人目不暇接。
从数量上来说，这些特效镜头的制作是超级英雄电影所必须的。
这也充分反映了杜克这个导演的制作方法和制作理念，即尽可能的利用特效制作，实际拍摄的镜头很多都需要经过电脑特效处理，这样做的好处是，使影片画面的呈现尽可能庞大而又具备冲击力。
而且那些实拍镜头也会对特效镜头的制作，提供足够的数据基础，这种做法可以创造一种高水平的现实，即视效画面能够匹配实景图像的高画质，也更接近杜克想要的影片状态。
早在前期筹备之初，后期团队就投入了很多时间来进行文件制作、勘测地形、扫描剧组成员、精确记录现场照明等，为了达到更好的效果，团队还专门为这部电影开发了一个关键工具，那就是可在现有管线和照明设置条件下工作的光线跟踪渲染系统。
这种系统能够准确计算不同曲面之间的能量交换，为不同曲面创造真实的灯光效果，这个过程要求有强大的计算机能力来进行计算，而且利用此技术制作出来的效果会相当完美，因为它让一些物体，如蝙蝠摩托车和蝙蝠侠的机车看起来有一种固有的真实感，能够很容易对其进行调整。
值得一提的是，这种新款工具箱制作效果时，不需要给出精确的分级指令，如让曲面看起来更亮、取消加亮区、对比效果等，现在只需要调节明暗就可以实现，其效果也可以达到镜头的要求，不仅简化了操作步骤，也让后期制作工作更有效率。
《黑暗骑士崛起》视效分为几个重要的片断，首选完成送到杜克手里的，是一开始的空中劫持镜头，在这个场景里，演员从一架c-130高空跳伞到另一架cia喷气式飞机上，破舱而入，带着一名囚犯逃脱并摧毁了该喷气式飞机的机翼，随后机身猛然一分为二。
这个镜头前期制作了高精度的样片，包括特效如何展现等等，精细的样片可以方便杜克研究如何处理绝技表演和真人实拍，以及需要制作哪些特效来配合此镜头。
最后呈现的效果也是多种制作方法的混合体，微缩模型和特效，制作飞机机翼断裂场景，绿幕抠景替换，再配合真实的飞机模型和两位实景拍摄的演员，最后加入跳伞的cg动画，完成了这个高难度镜头的实现。
另外一个片段是足球场的爆炸效果，影片当中的毁灭者贝恩，在足球场引爆炸药，制造了场地崩塌的场景，为了营造逼真的现场效果，团队利用可视化预览来策划实景拍摄，在这个场景中，特技演员要从位于场地上方的平台裂缝中掉落下来，为了配合效果，团队用cg动画制作了一些额外的演员，整个运动场地也都是由cg制作而成。
这个镜头的难度在于，整个场地都是物理的，团队需要有高水平的制作能力来控制这些模拟效果的真实感，并让这些物理效果与演员的动作同步。在这个镜头中还扩展了人群，利用了大约两万左右的人群坐在看台上观看比赛为基础，制作了球场上的一些镜头。
正如绝大部分视效电影，cg的应用通常在主要演员的数字替身上，《黑暗骑士崛起》也不例外。
数字替换主要包括了蝙蝠侠和猫女，当画面中出现角色驾驶着交通工具时，很多镜头其实都用到了数字关键帧动画，数字替身不仅仅是人物角色，有些机车也可以使用，如杜克拍摄的镜头中有一个场景需要蝙蝠摩托车爬上一个斜坡，并利用该斜坡作为跳板逃离陷阱。
这个镜头的最大困难是，由于蝙蝠摩托车并不属于轻便型摩托车，所以使它能够跳离斜坡又要看起来很不容易，这组镜头在制作时是使用了一台真实的特技摩托车来拍摄特技表演，然后视效团队逐步用一台数字蝙蝠摩托车来取代它，再将它调整到真实摩托车跳跃时的物理效果当中。
就像杜克说的那样，电影很多时候就是一门欺骗观众的艺术。
通过特效制作，杜克希望《黑暗骑士崛起》能呈现出一种格外写实考究的画面质感，那些冷峻傲然的色泽配合如工业设计一般的精细构图，给超级英雄电影另外一种可能性，在夸张的漫画风格与传统黑色电影之间架起一座互通的桥梁。
imax技术则是实现这些的重要基础。
毫无疑问，杜克在拍摄时获取的imax镜头是史无前例的，利用大高清格式帧拍摄了百分之五十左右的镜头，而imax大帧所要求的数据是普通一张2k图像的20倍左右，单就这些数据的运转来说都是一个庞大的逻辑工作，而从创造性的角度来说，其实大多数人并不能真正看到imax所做的东西，因为还没有可以支持这个数字屏幕的图像设备。
视效工程师们能够看到的是一张代理图像或图像的一部分，想看到整体图像的唯一方法，就是输出到imax上，而输出的过程也需要花费好几天的时间，并且只能在imax公司洛杉矶分部内完成，最终看到影片制作效果的第一人也不是制作人员，而是杜克这个导演。
所以整部影片不管是在创作上和还是制作上，对团队都是一个巨大的挑战。
不过，就像不惧怕竞争一样，杜克和他的团队也从来不害怕任何挑战。
在特效工作没有完成以前，杜克将剪辑工作暂时全部交给了麦克?道森，除去与特效团队忙碌特效制作之外，他还频繁与汉斯?季默会面，商讨关于配乐的事情。
由于时间过于紧张，《黑暗骑士崛起》错过了二月初的超级碗广告，尽管洛杉矶突袭者队实现了三连冠的伟业，杜克却没有时间去过多的关注自己的球队。
在三月初，汉斯?季默向杜克提交了一些配乐的初版。
在这部三部曲的终结篇里，汉斯?季默总结了前两部的主题配乐，然后有了现在的初版。
录音室里，激昂的音乐落幕，等杜克放下耳机，汉斯?季默详细的解释道，“我们为贝恩选择了完全不一样的配乐方向，我想用交响乐团来为人物的思维、情感代言，我跟演奏员们交代过，让他们抛开所有他们了解的东西，当一群最原生态的鼓乐手。’
说到这里，汉斯?季默笑了起来，“结果非常理想，大家觉得特别解放，像感受了一段音乐探险之旅。”
杜克也微微点头，虽然是初版，有些地方还待改进，但已经有了他想要的效果。
除了配乐，汉斯?季默还专门为贝恩配上了一段显著的唱诵。
利用这个机会，华纳兄弟的宣传部门特地让汉斯?季默与广大的蝙蝠侠迷进行了一次互动，以便让影迷参与到影片的原声大碟制作过程中，制造宣传炒作的话题。
影迷们可以通过ujam，一家专门上传作曲、音乐制作和音乐出版的网站，把自己的唱段传送过来。
全球数万名网友响应了这个活动，收到的音频文件被同步后，做成了一段强烈的唱诵，被杜克编配到了影片中。
汉斯?季默接受采访时说道：“我跟杜克提建议，这是一个回馈粉丝和影迷，让他们实际参与进来的一种渠道，一开始我们还是有所顾虑的，但最终的结果美极了。”
“我从来没有跟一个，对某一个想法如此执着，奋不顾身的人合作，而且这个想法几乎就是孤注一掷的。但最危险的地方往往也是风险最小的，”
随后，杜克也在接受采访时就此事发表了一些看法，“汉斯教会了我走偏门也能找到真理的方法，如果不走这些偏门，或许你永远无法做出一番惊人的表现。他能为每一部电影设定全新的目标，每一次都让你觉得高不可攀，甚至让你觉得完全不可能做到。”
如同片中的人物，为塞琳娜?凯尔编配的音乐是‘暧昧的，模凌两可的，这比直白的判断一个人好或坏要有意思得多，杜克制作的这部影片，就有相当一部分的灰色模糊地带，汉斯?季默恰恰用把这种模糊不清用音乐表现了出来。
用一根音乐的绳线连接三部曲的每一部的，则是汉斯?季默专为布鲁斯?韦恩编配的乐章。
蝙蝠侠配乐的主题最简单，最明了，两种身份的主题几乎永远不变。
忙碌到四月份的时候，影片的后期制作已经进入到了尾段，距离五月份的上映日期也越来越近，宣传攻势自然也愈发的猛烈。