五天后，细川信元基本肃清了领内残余的武田军，武田胜赖以及存活下来的重臣也都先后逃回了信浓，但是彼此之间的矛盾却愈演愈烈。
首先，武田信廉宣布在沓掛之战前，武田信玄就已经因为枪伤所引发的感染而去世。这虽然是为了挽回武田信玄的颜面，避免晚节不保的一种保护。但是同样的，对于第一次执掌大军的武田信赖来说，他的威望却遭受了严重的打击。
虽然细川信元早就猜测了武田信玄已死，但是听到死亡原因是枪伤感染，忍不住唏嘘不已。想当年自己在界町遇刺，也是身中一枪导致感染发热，但是自己却挺过来了，而武田信玄显然是因为年龄和身体的衰退，最终没能挺过来。
其次，是由于武田信玄死的太突然，死前一直处于胡言乱语的发热症状，不但没有明确武田胜赖做为下任家督，反而还说让竹王丸十六岁元服后继任家督之位。
为此，在甲府城的大广间内，武田胜赖和一干老臣双方各执一词，吵得是不可开交。
“我才是父亲大人中意的继承人！父亲大人既然将我从诹访家召回本宗，就是想将这家督之位传与我！不然的话，怎么不召回别人！而且，自从我回来，就不断的让我参与家中大小的一切事务，这不是委任这是什么？嗯？这足以说明父亲大人的心迹了！而且他老人家临死前就一直高烧不退，言语失常，这不能作为遗命！”武田胜赖坐在主位上，拍打着几案嚷嚷着。
“虽然主公临终前的言语，的确有些凌乱。但是主公在世时曾多次赞扬竹王丸的聪明伶俐，还说他将来会担负起武田家的大业，这可是有目共睹的，而且元服后的名字早都确立了，就叫武田信胜。”高坂昌信第一个反对胜赖，他样貌秀丽，据说与武田信玄有龙阳之癖。
当他听闻信玄猝逝，曾一度悲伤地想要切腹殉主，多亏了一条信龙的成功劝阻。
“那又怎样？竹王丸可是我的儿子，将来从我这里继承武田家的家主之位，也是未尝不可啊。”武田胜赖一副理应如此的样子。
“但是少主你，至今都未被赐予武田家族的通字“信”哦。”一条信龙言语讥讽，他可是武田信玄的异母弟，就连他这种继承一条家的支族，都有通字“信”，所以骨子里根本瞧不上，这个连通字都没有的武田胜赖。
“你什么意思！”武田胜赖像是被踩了尾巴的猫一样，他深深地感到这群老臣根本看不起他。言外之意就是他本来就是为了吞并诹访家，而送过去的继承人，而一个别人家族的继承人，怎么能再来继承武田家呢？叫你回来，仅仅是将家督之位下传而已。
“好了，都不要吵了！主公新亡，你们就开始窝里斗，成何体统！”武田信廉现在是笔头家老，同时也是武田信玄的同母弟弟，是目前武田家地位最高的一位了。
“武田大人，那您说现在该怎么办？”秋山信友开口问道，看了看周围空着的好几个位置，心中不免有些惆怅。
“现在我武田家要的就是稳定，不管这家主之位是胜赖少主，还是竹王丸，毕竟都是我武田家的人。如今竹王丸还小，的确无法处理政务，在其元服前，先暂时由胜赖少主作为传代。”武田信廉这种让武田胜赖作为其阵代(监护人)，也是一种巧妙的继承手法。
“那…好吧…”武田胜赖惆怅的叹了口气，他的师匠原昌胤不在了，在座的重臣都是上代老臣。他刚刚经历大败，根本无法服众，只能捏着鼻子认了。
因为如此以来，武田胜赖虽然无法直接继承家督，但是本身还是拥有了同等家督的地位。同样的，武田家的家臣在名义上，也是侍奉理论上的本家继承人竹王丸，自然也不会再多做闲事，比如嚷嚷着让胜赖滚蛋这种事了。
与此同时的细川信元，再次整军准备出阵。沓掛一战大胜武田家的消息，犹如长了翅膀的书信一般，传遍了整个倭国。
织田信长得知后大为高兴，传令细川信元总领伊势、尾张方面军，就近剿灭长岛一向一揆。而且随着东线战局被打开，其它各处的战役也相继发生了变化。
首先是织田信长的北线战局，朝仓、浅井联军突然听闻武田信玄败亡，武田大军遭受了灭顶之灾，顿时士气大跌，人心恍恍。
很快就让木下秀吉找到了突破口，成功劝降了浅井家臣山本山城的城主阿闭贞征。随后，云雀山城城主浅见景亲也投降了织田家。
织田信长趁机出兵攻打浅井家的月瀨城，当晚，月瀨城便开城降伏了，将整个朝仓、浅井联军紧紧地压缩在了小谷城一带。
其次是细川藤孝的西线战局，虽然调走了细川铁炮队，但是近江的明智光秀率军赶来，双方打得是旗鼓相当。武田家败北的消息传来，足利义昭立马慌神了，这可是他最倚重的一股势力啊。
很快，丹波国的豪族、八木城的内藤如安被松永久秀策反，临阵倒戈之下，三千丹波众被细川藤孝等人杀的是溃不成军，赤井直正和宇津赖重两人侥幸逃得性命，逃回了丹波国。
其实这个内藤如安的父亲内藤宗胜，原名松永长赖，是松永久秀的弟弟。在三好长庆称雄于畿内的时候，因攻打丹波国有功，才成为八木城的城主。
其后为了巩固人心，松永长赖娶丹波守护代内藤国贞的女儿为妻，并继承了内藤氏的名号，改名内藤宗胜。内藤如安就是松永长赖与内藤国贞的女儿所生的儿子，同时也是松永久秀的侄子。
永禄七年（1564年），内藤如安在路易斯·弗洛伊斯的介绍下，皈依了基督教。次年父亲长赖在与赤井直正的交战中被杀，内藤如安继任丹波守护代内藤家家督之位。此时三好氏的势力急剧衰退，丹波国国人赤井氏和波多野氏的势力崛起，并不断蚕食内藤氏的领地，所以他和赤井直正还有杀父之仇。
此次他力挺幕府，本想借机攀龙附凤，好巩固自家的领地。没成想挺幕军接连失利，细川信元又大胜武田家，立马就暗中联络他的大伯松永久秀，出卖了足利义昭。
很快，失去外援的义昭将军，被上万大军围困在了这毫无屏障、极具奢华的二条城。