所以到了长安之后，虽然董卓对吕布还算是信任，但是吕布和他手下们，却遭到了董卓手下西凉系的兵将排斥，经常遭到他们的嘲讽，这令吕布很是不爽。
而且一次吕布说错话，董卓当场大怒，直接发飙，随手抄起一柄手戟，便掷向了吕布，也幸好吕布武艺高强，反应速度足够快，闪身躲过了董卓扔向他的手戟，这才侥幸逃得一命。
要知道董卓可也是武将出身，虽然现在胖的跟猪一样，但是力气很大，而且以善射闻名，扔出的手戟准头肯定是不错的，要是吕布反应慢一点的话，估计当场就被董卓给干掉了。
虽然事后吕布赶紧向董卓赔罪认错，获得了董卓的原谅，但是吕布也惊出了一身冷汗。
董卓这个人的脾气就是这样暴躁，但是事情过去之后，也就不计较了，并未把这件事放在心上，依旧还是对吕布很是信任。
但是人心这种东西，一旦伤了的话，再想抚平，那就难了，董卓是把这件事抛到了脑后，可是吕布心里面却过不去了。
故此吕布心中很是暗恨董卓，终于被王允听闻后抓住了机会，后来王允便说服了吕布背叛董卓，加入到了他的除董集团之中，一群人便开始紧锣密鼓的准备刺杀董卓。
但是想要杀董卓也不是一件容易的事情，一是董卓自知得罪了天下不知道多少人，想要杀他的人不知道有多少，所以平时出入都带着大批的侍卫，而且他本身也是武将出身，别看胖的跟猪一样，但是却并不失灵活，另外董卓也力大无穷，真的动起手来的话，一般人还真不是他的对手。
恰好初平三年年初，关中地区大雨连绵，皇帝刘协身患重病，王允主持祭天祈福，趁机便和吕布等人商议了一个办法，趁着皇帝刘协病体康复的时候，请董卓入宫。
而吕布则提前准备好人手，在宫门处袭杀董卓，众人一拍即合，便紧锣密鼓的准备了起来。
四月的时候，连续下了两个多月的大雨终于停了下来，而且宫中的皇帝刘协也病体康复，于是王允便请董卓入宫见一下皇帝。
董卓并未提前发现这次王允请他入宫是暗藏杀机的，于是觉得不就是入宫见一下刘协吗？这又有多大的事情？于是便带了吕布，让吕布随护，坐车朝着皇宫而去。
此时吕布早已安排了手下猛将李肃以及数十名精干亲兵，伪装成董卓的护卫，躲在宫门之外等候着董卓的到来。
而吕布这个时候，怀揣了一份诛杀董卓的圣旨，这说明皇帝刘协也参与了这次诛杀董卓的行动，暗中颁发了圣旨给王允，王允将其转交给了吕布，令其伏杀董卓。
但是具体这份圣旨谁也没亲眼所见，只是吕布宣称有皇帝的圣旨，到底是不是皇帝刘协亲自颁发的圣谕就没人知道了。
不过当董卓大摇大摆的到了宫门的时候，埋伏在这里的李肃和数十名亲兵突然间发难，挥刀上前刺杀董卓，董卓大惊失色奔走逃命，但是却因为身体太过肥胖，加上也上了年纪，被李肃斩伤。
董卓大呼吕布救命，这个时候吕布取出怀中藏得圣旨，当众宣布乃是奉旨诛贼，当场将董卓给杀了。
董卓千算万算，怎么也没算到，他会死在他最信任的大臣王允和最信任的义子吕布手中，于是就这么窝窝囊囊的死在了宫门之外，脑袋也被吕布砍了下来，高悬在宫门之外示众。
董卓死后，长安城中文武百官、士绅百姓无不喜极而泣，是举城欢庆，庆祝董卓被杀，而且董卓死后，也没落得一个全尸，恨极了董卓的人，将董卓的尸体拖到大街上，扒得精光，看到董卓满身肥油，肥的跟一头肥猪一般。
于是有人在他肚脐眼开了个洞，塞入了一根蜡线点燃，蜡线点燃之后，炙烤着董卓肚皮里面的肥肉，让肥肉炼化成油，继续被燃烧，就这么一直把董卓的尸体当成了天灯，烧了很多天，最终董卓的尸体被烧成了一堆枯骨，又被人挫骨扬灰，除了脑袋之外，连一根骨头都没能留下来。
当董卓被杀之后，王允掌控了朝政，一边下令关闭城门，尽捕城中董卓的亲信全部将其诛杀，另外又立即任命皇甫嵩为征西将军，率军立即赶往郿县的郿坞，赶在董卓遇刺身亡的消息传到郿坞之中的时候，先赶到了郿坞。
郿坞中的董卓亲族家眷对此完全没有提防，皇甫嵩随即领兵就闯入了郿坞之中，将董卓的三族杀了个干干净净，不论男女老少，一个不留，全部都杀了个干净。
至此董卓算是彻底完蛋了，只剩下了在外领兵没有在长安的那些旧部。
任博获知了消息之后，立即便派人把这个消息送回到了豫州告知李琛，所以这个细作才想方设法的潜出关内，一路上不知道吃了多少苦头，赶在别人之前，把消息送到了李琛这里。
现如今按照细作所言，长安之中王允暂时掌权，另外招降了部分之前董卓的旧部，比如之前董卓的部下胡轸就投顺了朝廷，而王允主持朝政，授吕布为奋武将军、假节、仪同三司，封温侯，和王允一起主持朝政。
所以眼下看来，暂时长安方面，董卓算是完了。
不过细作却给荀家带来了一个不好的消息，荀氏八龙的六龙荀爽，却因为身体染病，在数月之前，病逝于长安城中。
此次王允谋刺董卓，其实荀爽也曾经参与过，也属于长安之中以王允为首的倒董联盟的一个重要成员，只可惜未能等到王允和吕布成功刺杀董卓，荀爽就因为染病一病不起，数月前病逝于长安城中。
但是因为关内关外现如今处于敌对状态，故此消息闭塞，荀爽的死讯一直到现在才被传回到颍阴荀家。
荀家上下人等闻听之后，皆悲声大作，因为荀氏八龙之中，尤以荀爽声望最高，早年又因为开罪阉党，常年避祸在外，隐遁于汉滨达十余年之久，好不容易朝廷才解除了党锢，刚回到颍阴不久，灵帝死董卓入京，强行将荀爽招入了京师。