进攻聚宝门的清军主将是屯齐，这里本来就是清军的主营所在地方，阿济格接到了正阳门、朝阳门都相继被攻破之后，立刻下令屯齐，也率军向聚宝门发动进攻。
这段时间以来，清军己经扎好了四百多个大木筏，在进攻正阳门、朝阳门各带去了一百个木筏，而在聚宝门一线，集中了二百多个木筏，以及一百多艘小船，开始强渡外秦淮河。因为这里有商家军守卫，因此清军也格外重视。同时还派出一部份兵力，进攻山川门，牵制住李定国部，实其不能来增援聚宝门。
如果仅仅只是聚宝门外的清军进攻，因为有外秦淮河为屏障，商家军的人数虽少，但也能抵挡住一阵，但清军攻破了正阳门和朝阳门被攻破之后，清军派出一支人马，在通济门附近渡过外秦淮河，沿着河北岸绕到聚宝门前，迫使商家军不得不分兵在外秦淮河北岸据守侧翼。这样一来，兵力就明显的捉襟见肘起来。
而就在这时，商毅也赶到了聚宝门外，这时战斗进行得正是激烈，在秦淮河面上，燃起了十几处火焰，将水面照得通亮，同时还有近百余艘舟船正冒着炮火，向北岸强渡过来。而在阵地的东边，也同时是枪炮之声，响个不停，显然也打得十分激烈。
商毅看了看现在的形式，就知道对商家军十分不利，聚宝门显然是守不住了，因此也告诉杨武丞，立刻下令，马上向城内撤退。
不过虽然是撤退，但也绝不是一下子就放弃阵地，全部都退回到城里去，而是先从阵地上撤回两个营，在聚宝门的城头驻守，然后其他各部队都携带着自己的武器，依次从阵地上撤退，并且留下了足够断后的人马，这样井然有秩向撤退行动，再加上清军渡河的功夫，十分顺利的就全部退到了南京城墙边之后，同时在城墙上还有接应的部队进行掩护。
入城之后，商毅立刻下令，留下一个团，由自己带领，留在城墙上驻守，抵挡清军的进攻，而杨武丞带领另一个团也迅速退到城内，在内秦淮河的北岸建立防守战线，准备城内的巷战。
而清军渡过了秦淮河之后，也一刻没有停，马上架起了云梯，又向南京城墙发动了进攻，商家军虽然只有一个团守卫城墙，但却依托着南京高大的城墙，枪、炮、手榴弹、霹雳火箭等武器一起发射，利用凶狠的火力，也给清军造成了很大的伤亡。
但仗打到这一步了，清军也不能退缩，依然向墙头发动了一次又一次的猛攻。而且清军毕竟是人数众多，在一个点强攻不下，就把战线拉开，分散商家军的驻守兵力，这一来果然有效，商家军的火力虽然猛，但兵力不是始终都是一个无法克服的劣势，长达数百步的城墙，根本无法全部照应得过来，因此在清军这样全面展开的进攻下，也有些坚守不住，在战线两侧的薄弱环节，己经有清军蹬上城墙。
好在是坚守城墙，只是为了给退守秦淮河一线拖挺时间，现在也坚守了差不多有犬个时辰，估计杨武丞在秦淮河北岸也己经差不多准备好了，因此商毅也立刻下令，放弃城墙，向内城撤退。于是士兵们也都纷纷收拾武器，向南京城中退去。
商家军一退，清军立刻蹬上了城墙，然后打开城门，放城外的大军进城。屯齐闻讯之后，也不禁大喜，因为他和努山开始的想法也一样，现在南京的城墙己有多处被攻破了，清军杀入城中，按照一般的攻城常识，南京己经算是被清军占领了，因此他一面向阿济格报捷，一面亲自率军进城。
在这时攻开了聚宝门的先头清军也并没有急于向城里深入发展，因为在刚才的攻城战斗中，商家军的火力也确实给清军造戌了相当大的损失，现在也需要调整一下。而屯齐在进城的时候，也发现在城墙下堆积着的清兵尸体，心里也觉得有些骇然，商家军的火力之强，果然是名不虚传。
不过不管怎么说，总算是攻进了南京，就算受点损失，那也是值得的，因此在屯齐策马进入聚宝门之后，心情还是十分愉快的。
而在聚宝山边的清军大营里，阿济格也是一夜无眠，随时都听候着进攻南京的消息。不过这一次战争的总体进展还算是很不错，好消息接二连三的传来，先是朝阳门被攻破，清军杀入南京城中，紧接着正阳门也被攻开，随后清军又占领了皇宫，现在聚宝门也被攻克了。这一来南京的东城南城就都被清军攻破，看起来这次除夕夜袭、内外夹攻收取南京的战斗，己经取得了全面的胜利。
当然阿济格同样也收到了清军在杀过皇宫，向南京的中部地区发展的时候，遇到商家军的顽强阻击，但在阿济格看来，那不过是商家军最后的挣扎而已，毕竟是大局己定，商家军就算再强，又能如何呢？现在南北二京，均在清军的掌握之中，大清统一天下的宏伟大业既将完成，而自己是攻取南京的清军主将，也必然功不可没。
因此尽管一夜没睡，但阿济格依然神釆奕奕，立刻下今，大军马上开拔，进入南京。等他走出大帐以后，这才发现，天色己经亮了。
第三卷 离乱篇 第二三六章 隐密
杭州、总督府。
天亮之后，陈圆圆、林凤舞、亚莉桑徳拉、朱媺娖都是被鞭炮的轰鸣声吵醒的，但一个个都还睡眼惺忪，要不是因为鞭炮声实在太吵人了，而且今天是大年初一，估计还要接待大量前来拜年的客人，都还想再睡过去。
不过在起床之后，毎个人都得到通知，叶星士请她们梳洗完毕之后，都到他的房间里去，有大事要说。
虽然她们都知道，叶星士是叶瑶瑱的爷爷，而商毅本身是无父无母的人，也把叶星士当自己的爷爷一样敬重，因此在这个督师府里，叶星士就等于是老祖宗一样的存在。但叶星士本身从来不管什么事情，而一个人独居一屋，来去自由，也不用人待伺，有多一半的时间不在督师府里。其实一天里还不一定碰得上他。
而且叶星士虽然年纪大，但脾气并不古板，而且又精通医术，又不计贫贵，有求必应，府里府外有不少人都蒙他诊脉治好，并还在杭州医好了好几个疑难杂症的病人，因此毎个人对叶星士都拿活神仙供着。
虽然不知道为什么一大清早，叶星士就把她们都招集过去，但他毕竟是长辈，而且大年初一，论礼也应当先去向他恭贺新年，因此众夫人们一个个都赶着梳洗妆扮，换上新衣吉服，来到叶星士的房里。
不一会儿，众人都到齐了，只是不见叶瑶瑱，她们到也没有多想，只当是叶瑶瑱起得晚了，现在还没有过来，那知叶星士起身道：“我们都不用等瑶瑱了，因为她己经不在杭州。”
四个人都不禁大吃了一惊，林凤舞道：“叶爷爷，您说什么？大夫人不在杭州？”心里想着，难道说是这老头在开玩笑吗？而其他三人也都有这样的想法，都看向叶星士。
但马上她们就知道这并不是玩笑话，因为叶星士道：“昨天晚上，瑶瑱收到一个重要的消息，商毅在南京遇到危险，必须要她亲自赶到南京去，才能够化解，因此她在昨天晚上，已经连夜离开了杭州，赶去了南京，在临走之前，只告诉了我一个人，让我在今天一早转告给你们？而且我向你们交侍完之后，也马上会赶去南京。”
其他人这时也知道叶星士是在说正事，但却都听得糊里糊涂，不过听说商毅有危险，当然是人人担心，因此也不顾别得，林凤舞马上问道：“相公出了什么事情，危险吗？为什么大夫人要连夜赶去南京，也没有通告我们一声？叶爷爷，这到底是怎么一回事？”
陈圆圆也道：“相公是不是病了，才要叶爷爷也赶去南京。”
听她这么一说，其他人也都顺着这个思路去想，为什么叶星士和叶瑶瑱都要赶去南京，莫非是商毅病了，这到也说得通，但叶瑶瑱为什么不等叶星士，连夜先走呢？或者说她得到了叶星士的真传，也会医术，因此连夜赶去南京，而叶星士不放心，也要赶去，这么解释虽然有些牵强，但也算合理。
叶星士苦笑了一声，道：“对不起，具体是什么情况，我现在确实不方便说，但你们放心，有我和瑶瑱在南京，商毅一定不会有事的。”
众人听了，虽然还是有些云里雾里，但总算是有点安心，因为叶星士并没有否认，而且在言语之中，似乎还确认了。就在她们胡思乱想的时候，叶星士又道：“现在瑶瑱和商毅都不在杭州，一但泄漏出去，恐怕会引起乱子，因此你们一定要严守秘密，包括府里的人，知道得越少越好，对外就说是瑶瑱病了，不能接见客人，其他的你们帮忙应付一下。而公务上的事情，让周世奇、王夫之、李岩他们去处理，我到了南京之后，会和商毅商量，怎样把这件事情圆过去。”
众人听了，也都把注意力转到杭州的现实上来，因为在商毅离开浙江以后，就是由叶瑶瑱代他处理政务，虽然俱体的各项事务都有专人付责，但最后却是由叶瑶瑱拍板定决，因此一但叶瑶瑱也不在杭州，那么现在整个浙江的政务肯定就乱了。万一有人心怀不轨，趁机弄事，那就更危险了。
她们四个都是十分明白事理的女子，被叶星士这一提醒当然知道这今，而叶星士提议装病，在现在来说，恐怕也是唯一解决的办法，虽然结果是一样的，但从其他人的心里上来说，叶瑶瑱仍然还在杭州，只是暂时不能理事了，结果当然就大不一样了。而且南京离杭州并不远，等叶星士赶到南京，商毅再正式下令，用飞鸽传书送回来，最多也就是二三天的时间，等到了那时，这个场也就圆过去了。
于是林凤舞也点了点头，道：“叶爷爷，您说得很对，相公和大夫人都不在杭州，我们可不能让杭州乱了，你们说是吗？”
亚莉桑德拉也点了点头，道：“菲妮说是没有错，他们都不在这里，就看我们的吧，总不能让他们回来以后，看到一个乱七八糟的杭州。”
有她们两人表态，陈圆圆和朱媺娖当然也没有意见，虽然她们都担心商毅的安危，但现在能做的也只有这些，总不可能大家都赶去南京吧，同时她们对叶星土的医术还是有信心的，因此事情也就这样决定了下来。
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天色大亮，虽然还没有全面控制南京城，而且枪炮的轰鸣声音还十分清楚，但现在整个皇城，都己是清军的天下了。
这时在皇城外围一个不起眼的小屋子里，以墨经纬为首的一群人聚集在一起。
墨经纬道：“马长老，昨晚一战，我们的损失怎么样了？”
马长老迟疑了一下，道：“禀报少主，杨护法和周护法，昨天都战死在皇宫里了。”
“哦！”墨经纬到有些没有想到，因为他对杨护法和周护法的武功还是有十足的信心，认为他们在混战之中，自保还是足够的，因此才把袭击皇宫的任务交给他们付责，却没想到双双都战死在皇宫里，顿了一顿墨经纬才道：“那么还有呢？”
马长老吞了一口口水，接着道：“黄长老、刘长老、冯长老、齐长老也都战死在皇宫里了，还有郑长老、严长老都身受重伤，在短期内己经不能在为圣门效力了，十六名坛主中，战死了七人，有四人受重伤；急风三十六剑，死了十二个，有七个受伤较重。其他的弟子中，战死了四百二十七人，受伤一百六十八人，现在还能调动的人手，还有二百一十三人。”
马长老越说，墨经纬的脸色就越难看，他万万没有想，在昨晚的战斗中，自己的人竞然会伤亡得这么惨重，这一次为了帮助清军攻取南京，圣门几乎可以算是精英尽出了，墨经纬当然也知道，那怕是一个最普通的弟子，也是经过了十年以上的时间经心培养的，不仅仅是个人的武功能力，关建对圣门的忠诚度，不是其他高手从能够替代得了的。至少又需要二十年时间，才能够慢慢的恢复。
如果说这一次行动的目标都能够实现，损失也就损失了，为了圣门的复兴大业，也是值得的，但尽管攻破了南京，占领了皇城，但最重要的目标，杀死商毅，却并没有实现，而且就是南京，也并没有完全占领，至少有一半还在商毅的控制之中。
这可是自已第一次策划执行指挥这样重要的任务，但最后却是一个这样的结果，确实令墨经纬难以接受，甚致他还不知道是那一个环节出了问题，因为在战前巳经制定好了详细的计划。早在江淮战役之前，就己经开始布置，从挑动南京和李自成的关系开始，一直到昨天的除夕之夜，可以说一切的进展都是在按照自己计划的进行，虽然在其中也出现过一个小意外，就是被商毅突然出手，抄了紫明楼，但从总体来说，都并没有偏离预先制定好的轨道。却想不到在这最后一战中，造成这样大的伤亡。
马长老又道：“现在在南京城内，商毅正以西御河和秦淮河为界，继续坚守着南京不退，和清军对持，清军现在久攻不下，而且损失也不小，而在南京城外，商毅依然占据着山川门以西北，因此要说清军完全占领南京，恐怕还差得远。少主，我们现在应该怎么办？要不要在帮清军一圮？”
墨经纬摇了摇头，道：“昨晚一战，我们的损失太大了，如果再和商毅作战，恐怕连最后的元气也难以保全。而且清军现在己经攻进了南京城，后面的事情就交给他们去做吧，我们就在这里坐山观虎斗。”顿了一顾，又道：“吴长老，玲珑那边有消息来吗？”
吴长老忙道：“回禀教主，玲珑小姐那边已经得手了，最晚明天上午，就可以带叶姑娘来到南京了。”
墨经纬的脸上，终于露出了一丝笑容，道：“很好，瑶瑱，我们终于又能够再见面了。”
第三卷 离乱篇 第二三七章 秦淮河之战（上）
朱由崧己死，南明的弘光朝廷也彻底终结，那么在这新的一年里，现在的中国大地上，只有一个年号，也就是清顺治三年（1646年）。
这时已是正月初一早上十时左右，但在南京城中，依然是枪炮震开，杀声不绝，激烈的战斗从昨天晚上开始，就一直没有停息过，丝毫没有一点新年的喜庆样子。
尽管这时清军已经攻破了南京的东城、南城，杀入南京城中，但实际控制的区域，只有东边的皇城，和南边秦淮内河以南的地区，而大部份的南京城区，依然还在商家军的控制之中。双方仍然在东、南两条战线上，进行着激烈的争夺。
其实秦淮内河并不箅是一个理想的阻击战线，不仅是因为秦淮内河的河面并不宽，河面上还有十余桥，而且这里太靠近南京的南城墙，另外秦淮河的流向，是呈一个由东向西，但中部凹陷呈v的形状，由其是在穿位于南门大街镇淮桥下的这一段河面，是最靠南端的河段，离聚宝门的城墙只有二三百步，如果清军将火炮架在城墙上，甚致可以直接打到秦淮河的北岸。
但做为一条过渡的阻击战线，秦淮河还是可以充份利用时，由其是现在清军的火炮还没有运进南京，投入战斗的情况下，商家军仍然牢牢的守住了秦淮河的防线，挡住清军向南京城内进攻。
在秦淮河阻击清军的商家军是一个步兵旅，其中四个营以秦淮河上的十余座桥为核心展开阻击，另外两个营则针对于清军的渡河位置，实行游动作战。步兵旅没有配炮兵营，使用的都随团的中小型火炮，虽然威力小、射程近，但却胜在移动方便，在这种阻击战线上使用，非常合适。
清军的进攻自然也是围绕着这十几座桥展开，同时也有一部份从河面上进行，先前渡外秦淮河所用的木筏也全都运进了城里，而且还收集了十几名彩舫，也拼命的在向对岸发动进攻，而且在河岸上还布置下了不少弓箭手，向对岸射击。
虽然内秦淮河的河面不宽，但少说也有六七十米，最宽的地方会达到百米，弓箭的射程根本就不够，只能釆用抛射，但这一来无论准度还是力度，都大大下降，而且商家军有掩体，有盔甲，因此伤害并不大。
商家军的战线收缩之后，布置的防线也更为严密，而且火枪却能够打到对岸，河水中的清军，就更是不在话下。同时还有手榴弹，如果能准确的扔到木筏和船舫里，就会炸死炸伤清军一片，就算是扔到河水里，也有六成左右可以爆炸，虽然炸不到船筏上，但却可以制造出冲天的水柱大浪，使船筏起伏不定。
而清兵就像下饺子一样，纷纷落水。何况还有不少火炮，在船筏的清军几乎毫无抵抗之力，现在正月初一，河水正寒，清兵多是北方人，掉到河水里也是凶多吉少，因此清军虽然兵力众多，却依然无法取得多少进展，相反还损失了不少兵力。
镇淮桥是内秦淮河上最大的一座桥梁，桥面宽达三丈有余，而且是全石砌而成，又是离聚宝门最近，因此也是清军进攻的重点地区。而商毅也把秦淮河防线的临时指挥部设在这里，指挥商家军进行阻击作战。
商家军在桥面上布置了双重防线，第一重防线守在定淮河的北端出口，是以四门火炮，两架管风琴枪为核心，辅以两个排的步兵，而第二重防线就在第一重防线后而不足十米，呈扇形展开，由一个连的士兵驻守，而且用家俱掂高，同时在两侧的屋顶上也布置了一排，还有一个班的狙击手，使镇淮桥的防线形成立体的守卫。
这样严密的布防之下，尽留清军向镇淮桥发动了一次又一次潮水般的进攻，而且什么方法也用到了，派弓箭在镇淮桥的南端，不计损失的和商家军对射；让士兵顶着桌椅做遮挡，向前冲锋；但全都收效不大。因为商家军的防守火力实在太过密集，由其是四门火炮和两架管风琴枪轮流开火，火炮付责轰开清军后遮垱物，而管风琴枪则毫不客气的收拾躲藏在后面的清兵。结果清军被打得死伤无数，在整个镇淮桥的后半段距离，几乎全都被清兵的尸体所覆盖了。
在这样激烈的战斗中，昔日充满了旖旎绮丽，万种风情的十里秦淮，这时已经全被战火硝烟所笼罩着，丝竹管乐、轻歌曼唱之音变成了枪炮的爆炸轰鸣，满载着风流才子，娇娆佳俪的五彩斑斓的画舫，被清军用来当做强渡秦淮的工具，在猛烈的炮火中香消玉沉，在而在两岸飞檐漏窗，雕梁画栋的建筑群，也在无情的战火中支离破碎。
而在曾经凌波清潵的河水里，此刻己飘满了破碎的船板、木片，以及清兵的尸体，呈现出一片混浊的暗红色。而且还不断的因爆炸激起冲天的水柱，还有不少落水未死的清兵，也在冰冷的河水中奋力的挣扎着。昔日金粉楼台，鳞次栉比；画舫凌波，桨声灯影的如梦如幻的美景奇观，已全被杀戮、鲜血、死亡所取代。
阿济格这时就站在聚宝门的门楼上，俯视整个南京的南城，整个秦淮河的防线，都可以尽收眼底，再加上现在也有了单筒望远镜，因此也可以把大部份的细节都看得十分清楚。而脸色十分难看，刚进南京时那意气风发的神情，早己荡然无存了。
就在这时，只听“轰”，一颗炮弹打到离城楼不足一丈的城墙上爆炸，只炸得尘士飞扬，砂石四射，也溅了阿济格一身，好在是他身穿重甲，到还并没有伤着。而阿济格身边的几个卫士都吓着魂不附近，赶忙过来，道：“王爷小心，这里太危险了，您还是到城外去吧。”说着就两个卫士过来拉他。
阿济格却勃然大怒，挥动马鞭，给了每人两鞭，大骂道：“没用的奴材，这有什么好怕的，本王东征西杀十几年，什么样的战场没有见过，还怕这小小的阵仗吗？”
见同伴被打，其他的卫士也不敢过来相劝，心里虽然叫苦不迭，但也没有办法。他们都是跟了阿济格十几年的人，知道阿济格的脾气暴燥，性如烈火，由其是在他心情不好的时候，最好是不要去惹他。
其实商家军都是使用的中小型火炮，射程有限，就算打到城墙上，以南京城墙的坚固，也完全承受得了，因此阿济格并没有什么危险。只足阿济格心里直到现在还不明白，这一场是怎么打成了现在这个样子，自己己经攻破了城墙，杀入南京城中，按说就应该箅是攻克了南京，而商毅也就应该承认失败，从南京撤退了。
但商毅不仅没退，相反还继续在南京城里驻守，就是不认输，那有像他这样打仗的，这不是无赖吗？就好像两个人下象棋，明明自己一步就可以把对手将死了，但对手偏偏就是不认输，还有重复走无用的废棋，摩蹭时间。
不过阿济格也知道，商毅当然不是在走无用的废棋，相反这一步棋还走得十分高明，他放弃了外围战线拉得太长的城墙，退守到城内，收缩战线，使清军兵力众多的优势根本就无法发挥，并且利用南京的内河做屏障，继续阻击清军，使清军尽管攻破了城墙，但依然无法占领南京。而从昨晚战斗开始，一直到现在，清军的伤亡人数己经超过了一万人。
从现在的情况来看，清军究竟什么时候能够取得全面的胜利，依然是在未知之中。但阿济格己经向把攻占南京的捷报发回到北京，现在也已经是骑虎难下了，只能够不惜代价，全力攻占南京。好在是南京到北京这一去一来，至少也要一个月的时间，也就是说自己还有充足的时间，只要在北京来使到达南京之前，完全攻占南京，也就能够交侍得过去了。
当然清军好不容易才打到这一步，阿济格也不甘心就这么罢手。南京可是和北京一样的坚城，己经都攻破了南京的城墙，怎么也不能够这么半途而废吧，何况清军的人数依然占有绝对的优势，既然兵力展不开，那就轮流上，就是累也就把商家军给累倒，而且阿济格也还有王牌还没有使出来。因此阿济格下令，不许停止，仍然要向商家军继续施压，凡事有作战不力者，立斩不敖。
阿济格的脾气，在清廷是有名了的，因此各路清军接到了阿济格向将令之后，包括汉军和降军，也都不敢有丝毫的怠慢，只能拼命向商家军的防线发动猛攻。
但进入火器时代以后，士兵的意志在战场上的作用也在逐渐减少，毎一座桥都被密集的火力网封锁住，各种火炮、步枪、管风琴枪、手榴弹一起发动，在这样猛烈的火气面前，清军攻得越猛，伤亡也就越大。
战斗一直进行到了中午，清军依然没有取得任何突破，而伤亡人数却又进一步上升。不过就在这时，阿济格一直在等待、并寄于了厚望的王牌部队，终于赶到了战场上。
第三卷 离乱篇 第二三八章 秦淮河之战（下）
阿济格等候的这支部队，其实就是清军刚刚组建的前锋营的火器部队，一共有一万名火铳兵，三千名火炮兵。共有各种火炮一百五十门，其中包括四十门红衣大炮，另外还有抛石机五十架。
虽然这支队伍从组建以来，还从来就没有在战场表现过其战斗力，但从多铎、洪承畴、阿巴泰等人总结的与商家军作战的经验来看，对付商家军最有效的，其实还是火器，就是用火器来制火器。现在的阿济格，也只能把自己的希望都寄于在这一支队伍身上。
因此这支火器部队一到，也立刻投入了战斗中，火铳兵马上赶到河边，取代了清军的弓箭手，在河岸边也布成三段连射，和商家军进行火枪对射，而其他的炮兵则七手八脚，将火炮运到城墙上。
不过一百五十门火炮，由其是其中还有四十门红衣大炮，每门至少都是在三千斤以上，想全部都运上城墙，也不是一时半会就能完成的工作。而在这时候，清军的火铳兵已率先和商家军交上了火。双方隔着秦淮河，互相都填弹开火，“砰砰啪啪”展开了一阵对射。枪声顿时响彻秦淮河两岸，也比先前密集了一倍有余，而争夺秦淮河的战斗，也进行得更为激烈了。
虽然在以前的战斗中，清军也曾大规模的使用过火器与商家军进行战斗，但主要是用火炮，像这样有成建制的火枪部队参战，却还是第一次。而清军的战斗方式一下子由中世纪升级到了十五、十六世纪的水平。看来商毅的蝴蝶翅膀，己经扇动了不少的风暴，凊军的战斗方式，居然也开始呈现出跳跃式的发展，而这一场战场也有了一点真正的火器时代的战争味道。
尽管如此，商毅在阵地中用望远镜也看得十分清楚，清军使用的火枪，大部份都是火绳枪，也有一部份是引线枪，另外还有少量的煫发枪。当然尽管清军所用的都是最老式的煫发枪，但对这个时代的中国来说，也己经是一个极大的进步了。这也和目前的世界发展大体相当，现在欧州各国其实也仍是以火绳枪为为主，煫发枪的普及，还要等到下个世纪。
虽然是同样使用火器，但双方仍然不是一层次，因为商家军已经是全部使用的火冒撞击式煫发枪，无论是在射程还是射速，比清军都高出一个层次。秦淮河虽然不算宽，但在这样的距离之中，清军只有煫发枪和鸟铳免强可以够得上射程，向三眼铳这样的引线枪，根本就不够。因此实际上清军只有七千多人可以投入战斗中。
而在发射频率上，虽然双方同样都是三段连射，但在一分钟内，清军最多只能射击四到五次，而商家军却可以达到九到十次，这不仅反是因为煫发枪的填弹速度更快，而商家军在使用火枪的经验和战场适应性上，也比清军要强得多。毕竟在真正的战场上填弹射击和平时的训练是两码事，现在的商家军，基本可以在战场上发挥出平时训练的九成水准，而清军最多只能发挥出六成。
再加上商家军中还有三十二架管风琴枪，除了填充速度慢这个弱点之外，可以管风琴枪己是这个时代最强的陆军武器了，因此虽然清军的火铳兵加入了战斗之后，尽管在声势上打得到是很热闹，但在实际的效果上，仍然没有多少起色。
但就在这个时候，清军的火炮终于开始发威了。虽然清军的火炮并没有全都运上城墙，但也完成了大半，红衣火炮也运上来了二十多门，因此阿济格也下令，先运上城墙的火炮首先开火，向秦淮河北岸发动轰击。
清军进攻的重点当然就是秦淮河防线体v形底部地带，而且在一百五十门火炮中，至少有一百门以上，够得上射程。而四十门红衣火炮，当然是都够得上的火炮之列。
“轰——轰——轰——轰——”
南京城墙上发出了惊天动地的巨大轰鸣声，将一颗颗炮弹狠狠的砸向了秦淮河北岸，也使在开战以来，清军首次在声势上压倒了商家军。
虽然清军的火炮使用的都是实心弹，而且精准度也十分有限，但却是在这一战中，终于能够对商家军造成实质性的危胁了。一颗炮弹呼啸而过，落到秦淮河的北岸，带出巨大的力量，砸向对岸的建筑和街道，只砸着瓦砖粉碎，砂石飞溅，梁断檐拆，墙裂窗穿，同时当然也砸中了不少的商家军士兵。
不过商家军显然并没有因为清军的火炮参战而退缩，依然固守着秦淮河的防线，同时一些火炮也调整角度，向城墙上射击，但因为缺少重型火炮，效果也不显着。同时又向城墙上发射了几个霹雳火箭箱，但因为霹雳火箭的精准度不高，因此不是落到城壁上就是飞过了城头，落到了城外，能够准确的落到城头上，并没有几支，因此对凊军的杀伤力度也不大。
直到这时，阿济格的脸上才稍微有一点缓和，不管怎么说，清军总算是开始挽回局面了，尽管还没有压倒商家军，至少也是一个好的开始，看来对付商家军，火器确实是一个有效的手段。
随着清军的火炮都被搬到城头上，而秦淮河防线，由其是镇淮桥一带的位置离城墙太近这个弱点，这时也开始慢慢的暴露了出来。越来越多的炮弹落到了秦淮河的北岸，对商家军的杀伤力也在逐渐的加大。由其是在五十架投石机参战之后，效果也就更为明显，投石机投出的当然不是石头，而是清军制造的手雷，其实就是带木柄的空心圆球，将引线点燃之后，用投石机给扔出去，一次可以投出五六个这样的手雷。
虽然有一些手雷落到河水里，有一些虽然落到了对岸，但引线却熄灭了，成功爆炸的，还不到一半，但这样的成绩对于清军来说，也己经是相当可观了，因为清军终于可以把爆炸性的武器打到秦淮河北岸去了。而且随着扔过秦淮河的手雷越来越多，商家军的伤亡也在开始增在，同时防线也终于松动了。
而且和商家军的火炮的准度较高，而且主要是针对清军的阵线和河里的船筏，并没有故意攻击建筑，而清军仍出的手雷就没有任何准头可言，只能说是扔到那里算那里，因此有不少是落到建筑上，在爆炸破坏之后，还引起了许多的着火点，在这个时候，商家军当然没有精力来救火了。虽然现在的火势还不算大，但这个时代的建筑都是以木质居多，一但蔓廷起来，也就难以收拾了。
幸好是中国古代的城市设计己经有了很高的水平，像南京这样的都城级城市的规化，都会充份的考虑到防火问题，在设计街道时，也都是有意将建筑分割成无数的小片区域，一个区域着火，在一般情况下，不会蔓延到其他的区域。想引发全城性的火灾，除非是在多个地点同时举火，因此到不用担心这方面的问题。